En la mitad de los casos no se conoce la causa de las malformaciones congénitas. Se sabe que algunos agentes pueden afectar al feto modificando sus estructuras o algunas partes del cuerpo. Algunas de estas causas son: los trastornos genéticos, los trastornos cromosómicos, algunos agentes físicos, la exposición a ciertas sustancias químicas y algunos procesos infecciosos en la mujer embarazada.
En más del 50% de los casos las causas de las malformaciones congénitas son desconocidas.
Se sabe que ciertos agentes pueden afectar al desarrollo del embrión y producir malformaciones.
Algunas causas conocidas son:
- Los trastornos genéticos. Este tipo de trastornos se producen por la alteración de los genes.
- Los trastornos cromosómicos: se producen por anomalías en los cromosomas.
- Los agentes físicos: se producen por la exposición de la mujer embarazada a radiaciones.
- Las sustancias químicas: se producen por el consumo de medicamentos durante el embarazo.
- Los agentes infecciosos: se producen por infecciones víricas contraídas por la mujer durante el embarazo.